硬度能在EDI超纯水机单元中引起结垢，结垢一般在浓水室膜的表面发生，该处pH值较高，易形成结垢层。此时，浓水入水和出水间的压力差增加膜通量降低。超纯水机组件设计采取了避免结垢的措施。不过，使用软水机将会延长清洗周期并且提高EDI系统的寿命。

浦膜PMC系列实验室长期运行，会出现膜污堵的现象，这些是由悬浮物和胶体所引起的。树脂间隙的堵塞导致EDI组件的压力照成损失增加。有机物会导致树脂和膜的表面被污染，被污染的膜和树脂迁移离子的效率降低，使得产水水质下降，膜堆电阻将增加。

在实际使用条件下，由于水中各种离子成分不同，温度、平均水通量选取值、系统回收率等均不同于标准测试条件，而这些因素均会影响到膜元件的脱盐率。系统脱盐率为整套反渗透装置所表现出来的脱盐率，同样由于使用条件与标准条件不同。

应用离子交换树脂去除水中的阴离子和阳离子，是运用时间较长的一种传统用来制取纯水的工艺方法，经处理后可获得一定纯度的超纯水，但水中仍然存在可溶性的有机物，可以污染离子交换柱从而降低其功效，去离子水存放后也容易引起的繁殖。

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